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交通系统和软件的内部构造和工作机制涉及到许多复杂的技术和组件，包括硬件、软件、网络等各个方面，关于机械硬盘在存储交通系统和软件数据时的内部情况，可以概括如下：
机械硬盘内部主要由盘片（存储数据的介质）和读写头组成，当交通系统和软件的数据需要被存储时，机械硬盘的读写头会在盘片上进行移动，将磁信号以二进制数据的形式存储在盘片上，这些数据可能是交通系统的程序代码、地图信息、用户数据等，或是软件的各种文件和数据，硬盘内部的电路板和接口负责数据的传输和控制。
具体到交通系统和软件的内部结构和运行机制，涉及大量的复杂编程和系统设计，交通系统可能包括交通信号控制、路线规划、车辆调度等模块，这些模块通过软件来协调和控制整个交通网络，软件的运行则依赖于计算机硬件的支持，包括处理器、内存、硬盘等，软件通过操作系统提供的各种接口和工具进行开发，以实现特定的功能。
机械硬盘是存储数据和程序的一部分，而交通系统和软件的内部结构和运行机制涉及到复杂的编程和系统架构设计，由于涉及的领域和技术非常广泛和深入，建议查阅相关领域的专业书籍或咨询专业人士以获取更详细和准确的信息。